Scrittore, regista, produttore e tecnico. Prima di lavorare a Dark Skies - Oscure Presenze ha diretto e prodotto la prima, della durata di due ore, di Defiance, un'innovativa serie televisiva multipiattaforma di azione/fantascienza per NBC/Universal e Syfy Channel, la cui anteprima è prevista per aprile 2013 su Syfy Channel.
Nel 2011, Stewart ha diretto l'adattamento cinematografico del fumetto della Tokyopop Priest per Sony/Screen Gems, con Paul Bettany, Karl Urban e Christopher Plummer. Il film è stato prodotto da Mike DeLuca (The Social Network) e Josh Donen (Spartacus: Blood and Sand).
Nel 2010, Stewart è stato coautore e regista del riuscito thriller soprannaturale della Sony/Screen Gems Legion, con Dennis Quaid, Paul Bettany, Tyrese Gibson, Kate Walsh, Lucas Black e Charles Dutton. All'inizio di quest'anno, Syfy Channel e Sony Pictures TV avevano annunciato un adattamento di Legion a serie TV, con Stewart in qualità di produttore. Stewart è stato inoltre coautore del prequel in quattro uscite del fumetto "Legion: Prophets" per IDW Publishing (30 Days of Night).
Esperto artista e tecnico di effetti speciali, Stewart è stato co-fondatore di "The Orphanage", rinomato studio di effetti speciali che ha realizzato gli effetti visivi per più di una ventina di importanti film, tra cui grandi successi come Iron Man, Pirates of the Caribbean: Dead Man's Chest (Pirati dei Caraibi - La maledizione del forziere fantasma), Pirates of the Caribbean: At World's End (Pirati dei Caraibi - Ai confini del mondo), Sin City, The Day After Tomorrow (L'alba del giorno dopo), e Hellboy.
Durante la sua esperienza con The Orphanage, Stewart ha fondato gli Orphanage Animation Studios con l'animatore Genndy Tartakovsky, vincitore di diversi Emmy e creatore di cartoni animati del calibro di Star Wars: The Clone Wars, Samurai Jack, e Dexter's Laboratory (Il laboratorio di Dexter). La prima produzione dello studio è stata la serie animata originale Sym-Bionic Titan, che ha esordito su Cartoon Network nel 2010 ottenendo grande seguito.
Prima di co-fondare The Orphanage, Stewart era un artista di effetti speciali alla Industrial Light & Magic di George Lucas, dove ha realizzato effetti speciali per numerosi film di successo, tra cui Star Wars - Episode One: The Phantom Menace (Star Wars: Episodio I - La minaccia fantasma) e Lost World: Jurassic Park (Il mondo perduto - Jurassic Park). Si è laureato in produzione cinematografica alla Tisch School of the Arts dell'Università di New York nel 1991.