W. Morgan Sheppard ha lavorato con diversi, apprezzati registi, fra cui Michael Bay, Sir Trevor Nunn, Chris Nolan, Sir Peter Hall, Peter Brook, Ron Maxwell, Sir Richard Attenborough, Michael Mann e David Lynch, in Transformers, The Prestige, Gettysburg, Star Trek VI, Wild at Heart, Needful Things, The Elephant Man, The Keep, Cry Freedom, Elvira, Marat-Sade. E' inoltre noto per il suo lavoro televisivo che comprende diverse apparizioni in Criminal Minds, Gilmore Girls, Cold Case, Alias, Star Trek Voyager, Tracey Takes On, Frasier, Quantum Leap, JAG, Star Trek: The Next Generation e Max Headroom; quest'ultimo telefilm lo ha portato negli Stati Uniti dalla sua terra d'origine, in Irlanda.
La carriera teatrale di Sheppard vanta trent'anni di successi in Inghilterra. E' stato artista associato della Royal Shakespeare Company per più di dieci anni. A Broadway, ha dato vita al ruolo di 'Mad Animal' in Marat-Sade negli anni '50 e 60' e in seguito è apparso in Sherlock Holmes negli anni '70. Negli Stati Uniti Sheppard ha vinto il LA Drama Critics Circle Award e il Drama Logue Award per la sua performance del 1995 in The Homecoming di Harold Pinter al Matrix Theater.