L'insegnante Ichikawa (Sho Aikawa), noto anche come Zebraman, si risveglia improvvisamente 15 anni dopo nel 2025. La megalopoli di Tokyo ora è stata rinominato Zebra City. La città è diventata virtualmente senza criminalità a causa libera di una nuova misura denominata 'Zebra Time'. Ogni mattina e sera per cinque minuti 'Zebra Time' viene implementata, e permette alla polizia Zebra di eliminare eventuali potenziali criminali. Abbastanza presto, Ichikawa diventa l'oggetto di attacchi da parte della polizia Zebra, ma viene salvato da Ichiba (Naoki Tanaka) e portato in un luogo sicuro noto come la 'White Horse House'. Al 'White Horse House,' i sopravvissuti del 'Zebra Time' si ricoverano dalle loro ferite, mentre complottano dei metodi per rovesciare il governatore della città, che ha implementato 'Zebra Time'. Durante tutto questo, Ichikawa ha perso la memoria e non ricorda il suo passato come Zebraman...