Alfonso Gomez-Rejon nasce il 6 novembre 1972 a Laredo, Texas. Si diploma e riceve il BFA dalla New York University e successivamente consegue il master presso l'American Film Istitute(1997). Inizia la sua carriera lavorando come assistente personale per Alejandro González Iñárritu, Martin Scorsese, Nora Ephron e Robert De Niro, prima di passare al lavoro di seconda unità per il cinema e di regista televisivo e pubblicitario. Acquisisce molta esperienza dietro la macchina da presa anche grazie al suo lavoro in film come Babel, Julie & julia, Argo e Mangia prega ama.
Il successo
Il suo debutto alla regia avviene nel 2010, quando inizia a lavorare per vari episodi della serie televisiva Glee, creata Ryan Murphy. L'anno seguente, sempre a fianco di Murphy, lavora come regista e co-produttore esecutivo per un'altra serie televisiva, American Horror Story.
Nel 2014 dirige il suo primo lungometraggio per il cinema, l'horror The Town That Dreaded Sundown, prodotto da Ryan Murphy e Jason Blum. L'anno seguente presenta al Sundance Film Festival Quel fantastico peggior anno della mia vita, ricevendo una standing ovation. Il film inoltre si aggiudica il Gran premio della giuria: U.S. Dramatic e il Premio del pubblico.