Attore canadese è nato a Ohsweke, Ontario nella nazione Cayuga e Wolf Clan, della confederazione irochese Ha frequentato la Syracuse University e la Ryerson Polytechnic University, dove ha studiato fotografia e produzione cinematografica.
Il suo primo ruolo importante è stato quello in Spirit Bay, ma quello per cui è più conosciuto è quello della guida spirituale Nessuno che assiste il fuggitivo William Blake (Johnny Depp) in un visionario Far West nel film Dead Man (1995) di Jim Jarmusch. Ha avuto un cameo nello stesso ruolo anche in Ghost Dog - Il codice del samurai (1999), sempre diretto da Jarmusch. Recentemente è apparso nel film americano Jimmy P., diretto dal regista francese Arnauld Desplechin, ambientato tra i nativi americani del Montana nel dopoguerra.
Farmer è stato anche editore della rivista aborigena "Voices", uno dei fondatori della rete radio aborigena, ed è un accanito sostenitore di progetti multimediali dedicati ai nativi al cinema, alla radio, e in televisione.
Ha anche una blues band chiamata "Gary Farmer & the Troublemakers", che ha pubblicato due album.