Gli esordi
Nato a Los Altos in California, in una famiglia di cinque fratelli Josh Zuckerman inizia a recitare già all'età di dieci anni. Formalmente inizia la sua carriera cinematografica nel 2000 apparendo nel musical fantasy della Disney, Geppetto, accanto a Julia Louis-Dreyfus e Drew Carey. Appare poi in alcune serie televisive tra cui New York Police Departement e Once Again. Continuerà a recitare pur frequentando la Princeton University. Il 2002 lo vede sul grande schermo nel ruolo del piccolo Dr. Evil in Austin Powers in Goldmember (2002) accanto a Mike Myers.

Un giovane talento comico
Con una carriera ormai lanciata anche sul grande schermo, John Zuckerman appare nel 2004 nella commedia natalizia, Natale in affitto, accanto a Ben Affleck e James Gandolfini. Sarà poi in Pretty Persuasion (2005) e nel film di culto, parodia del genere horro-survival, Feast (2005). Nel 2006 appare invece in L'amore giovane diretto da Ethan Hawk. Era inoltre apparso sul piccolo schermo in un episodio post 11 settembre di The West Wing prodotto dalla NBC. Oltre ad apparire in diverse serie di successo, tra cui Dr. House, Boston Legal e CSI: Miami, Josh Zuckerman sarà nel 2007 nel politico Leone per agnelli, diretto da Robert Redford, con Tom Cruise e Meryl Streep. È la prima volta di Zuckerman in un ruolo impegnato in cui interpreta uno studente del professore universitario interpretato da Redford. Il 2008 lo vede tornare ai ruoli a lui più consoni, in particolare nella commedia Sex Movie 4D dove ottiene finalmente un ruolo da protagonista. Dal 2006 era d'altra parte un personaggio fisso, Maek, della serie Kyle XY.