Protagonista assoluta di questa serie tv è la scienza, la materia che più ha contribuito alla conoscenza e al progresso nel mondo. Al suo interno, esiste, come in ogni campo, un confine che non deve mai essere superato: quello che separa nettamente la ricerca scientifica, da mettere in atto solo per scopi benefici, dagli abusi degli esperimenti, messi in atto da persone senza scrupoli.
E' questo il terreno esplorato da Eleventh Hour, quello degli abusi scientifci, grazie alla figura del dottor. Jacob Hood, brillante biofisico che lavora come consulente per il Governo. La sua curiosità verso la scienza lo porta talvolta a perdere il contatto con la realtà e il senso del pericolo, mettendo così a rischio la sua vita. Per questo motivo, l'agente speciale Rachel Young lo affianca.