John Cohen ha in un primo tempo lavorato presso la 20th Century Fox per sette anni. Come vice presidente della 20th Century Fox Animation, ha operato in stretta collaborazione con la Blue Sky Studios su film come L'era glaciale, Robots, L'era glaciale 2 e Ortone e il mondo dei Chi. Ha quindi acquistato i diritti di Alvin Superstar e nel 2007 ne ha realizzato il film. Questa proprietà è adesso arrivata a valere quasi 1 miliardo di dollari per gli studios. Cohen è attualmente produttore per la Illumination Entertainment che ha creato il campione d'incassi mondiale Cattivissimo Me.
Oltre ad Hop i prossimi film in produzione della Illumination per Universal Pictures sono Dr.Seuss - The Lorax, diretto da Chris Renaud; Flanimals, basato sulla serie di libri di Ricky Gervais, e Where's Waldo, e il nuovo film in stop-motion basato sui personaggi della Famiglia Addams, creata da Charles Addams, e diretta da Tim Burton.
Prima di arrivare alla Fox, Cohen aveva collaborato con la Scott Rudin Productions. Nel 1998 si è laureato alla Tisch School of the Arts presso l'Università di New York.