Jonathan Liebesman è nato e cresciuto a Johannesburg, Sud Africa e dopo il liceo ha frequentato la South African School of Film and Drama prima di trasferirsi negli U.S.A. per studiare alla New York University's Tisch School of the Arts. Liebesman ha scritto e diretto un corto, "Genesis and Catastophe", basato su un racconto di Roald Dahl, che è stato presentato a numerosi festival e suscitato molto interesse. La sua prima regia è stata Darkness Falls, che ha esordito al primo posto in classifica, poi Walter Parkes della DreamWorks gli ha chiesto di dirigere il corto Rings, che doveva fare da ponte tra The Ring e The Ring 2. Per il produttore Michael Bay ha quindi diretto Non aprite quella porta - L'inizio. Liebesman ha inoltre diretto The Killing Room, con Timothy Hutton, Chloe Sevingy, Peter Stormare e Nick Cannon, prodotto da Eleven Eleven Films e Management 360, presentato al Sundance Film Festival e poi al Deauville Film Festival.
Nel 2012 è nelle sale con il film action-epico La furia dei Titani, secondo capitolo della saga che racconta la furia di Perseo e gli intrighi degli Dei dell'Olimpo.