Davide Pepe è nato in Puglia, a Ceglie Messapica, nel 1970 e vive e lavora a Bologna. Dal 1995 sviluppa, gira e produce cortometraggi artistici e video di musica e danza. Lavora anche come montatore, compositore e sound designer.
Tra i suoi lavori più recenti figura Last kodachrome 40 for a Nizo s800, un'installazione su tre schermi che verrà esposta in occasione della mostra "Flicker: artist & Super 8", che si terrà presso il Bury St. Edmunds Smiths Row a partire dal 19 gennaio 2013. Si segnala poi Memories Are Haunted Places: A Ten Year Retrospective of the Inner Cinema of Davide Pepe, una rassegna di sette cortometraggi firmati dal regista e video-artista, che saranno proiettati nell'ambito del London Undergrounf Film Festival (dicembre 2012). The Fallen Body è un documentario artistico, commissionato dall'associazione culturale di Beatrice Bulgari, "Corto Arte Circuito", nell'ambito della mostra su Antony Gormley "Vessel" alla Galleria Continua di San Gimignano.
Pepe ha diretto anche un film per "Jhonn, uttered Babylon", album dei Myrninerest, un'opera ricca di suggestioni allucinatorie, realizzata con materiale d'archivio tratto dalla collezione privata di David Tibet e con le fotografie fornite dal padre di Jhonn Balance, per essere proiettata alle spalle della band durante i concerti. Schrei 27, realizzato in collaborazione con il musicista d'avanguardia Diamanda Galas, è stato proiettato in numerosi festival e musei nel mondo. La serie Cities è stata realizzata in collaborazione con Salvatore Bevilacqua. Il progetto si basa sugli scatti di molteplici paesaggi cittadini realizzati in giro per il mondo, tra cui Bologna, Düsseldorf, New York, Winterthur, Marzamemi (Sicilia), Banska Bystrica (Slovacchia) e Londra. Altri lavori firmati da Pepe sono Giardini di luce, selezionato al 60° Festival di Berlino, Simple present - Future Perfect e A piece of my sky is missing - Famiglia di gru con nido, che sono stati selezionati al Minneapolis Walker Art Center.
Nel 2004 Pepe ha avviato una collaborazione con James Mackay, il produttore di Derek Jarman, con il quale sta lavorando a nuovi progetti per video-installazioni. Il regista collabora anche con altri artisti d'avanguardia e musicisti come David Tibet e Steven Stapleton.