Ha debuttato dietro la macchina da presa nel 2004 con Una casa alla fine del mondo, scritto da Michael Cunningham, e interpretato da Colin Farrell, Robin Wright Penn, Dallas Roberts e Sissy Spacek. L’anno scorso ha diretto Flicka-Uno spirito libero, con Alison Lohman, Tim McGraw e Maria Bello, per la Fox 2000 Pictures.
Tra i maggiori registi teatrali attualmente sulla scena, Mayer ha all’attivo un’impressionante lista di opere di Broadway tra cui Spring Awakening (Tony Award, Migliore Regia di un Musical; Premio Drama Desk, Migliore Regia di un Musical), Thoroughly Modern Millie (Premio Drama Desk, Migliore Regia di un Musical); An Almost Holy Picture; Uncle Vanya; You're a Good Man, Charlie Brown; The Lion in Winter; Side Man (portato in scena anche a Londra e Washington, DC); A View from the Bridge (Premio Tony per il Miglior Revival); e Triumph of Love.
Passando ai teatri Off-Broadway, la sua carriera comprende The Credeaux Canvas, Stupid Kids, Baby Anger, Antigone in New York, e View of the Dome. Inoltre, ha diretto diverse produzioni di An Almost Holy Picture (La Jolla, California; Princeton, New Jersey), Thoroughly Modern Millie (La Jolla, CA), e la tournée nazionale di Angels in America. Mayer è anche il Direttore e Regista Residente del Manhattan’s Roundabout Theatre.