Francesco Fei è un regista italiano di film e documentari, di cui è autore e anche produttore con la sua casa di produzione Apnea Film. Si afferma come regista realizzando numerosi clip con i più importanti musicisti italiani, fra i quali Franco Battiato, Litfiba, Ligabue, Verdena, Blu Vertigo, Carmen Consoli e molti altri.
Il suo primo lungometraggio, Onde, viene selezionato al prestigioso Festival di Rotterdam e in numerosi altri importanti festival internazionali come San Francisco, Rio de Janeiro, Karlovy Vary, ecc. Il film vince il Premio della Giuria al Festival del Film Italiano di Villerupt e viene segnalato dalla critica come una delle opere prime italiane più interessanti del 2006.
Nel 2016 dirige e produce la docufiction con Filippo Timi Segantini - Ritorno alla natura, selezionato al Biografilm Festival dove ha vinto il Premio del Pubblico, uscito con successo al cinema con Nexo e trasmesso da Sky Arte. Nel 2018 il suo documentario La Regina di Casetta ha vinto il Premio Miglior Film Italiano al Festival dei Popoli e la Genziana d'Oro al Trento Film Festival oltre che essere trasmesso su Fuori Orario di Rai 3.
Nel 2019 è uscito nei cinema con Nexo in più di 400 sale, il suo documentario Dentro Caravaggio, candidato ai Nastri d'Argento del documentario.
Il suo secondo lungometraggio Mi chiedo quando ti mancherò, è stato presentato ad Alice nella Città della Festa del Cinema di Roma 2019 e al Festival del Cinema Giovane di Castellinaria dove vince il Premio della Giuria.
Il suo documentario La via incanta, una produzione Sky Original tratta dall'omonimo libro di Marco Albino Ferrari, nel 2022 ha vinto il Premio come Miglior Film al Sestriere Film Festival e una Menzione Speciale allo Swiss Mountain Film Festival di Pontresina e al Verona Mountain Film Festival.
Nel 2022 cura la regia del film sperimentale "Peregrin and the Giant Fish", tratto dal libro "Die Fischreise - Il viaggio sul pesce" scritto e disegnato da Tom Seidmann-Freud, nipote di Sigmund Freud, con protagonisti le marionette della famosa Compagnia Carlo Colla & Figli, prodotto dalla Pinacoteca di Brera e uscito con successo nelle sale cinematografiche milanesi del circuito Anteo.
Nel 2023 il suo documentario X sempre assenti sul gruppo rock Verdena è stato presentato come evento speciale al Biografilm Festival.
Ha collaborato con importanti artisti contemporanei, come Giuseppe Penone, Jenny Saville e Velasco Vitali e realizzato opere di video arte esposte al Festival del Cinema d'Arte di Montreal, alla Biennale d'Architettura, a Arte Cinema, a Schermi dell'Arte ed in importanti musei e gallerie italiane come la Fondazione Salvatore Ferragamo e il Pac di Milano.
I suoi film sono presenti su piattaforme come RaiPlay, Sky e Now Tv, Nexo Digital.
E' docente di Regia all'Accademia di Belle Arti di Bergamo.