L'inimmaginabile è accaduto... Equestria ha perso la sua magia! I pony, gli unicorni e i pegasi non sono più amici e ora vivono separati tra specie. Ma l'idealista Sunny (Vanessa Hudgens) è determinata a trovare un modo per riportare l'incantesimo e l'unità nel loro mondo. In coppia con l'unicorno Izzy (Kimiko Glenn), si dirigono verso terre lontane dove incontrano le carismatiche e coraggiose Ruby Petalosa (Sofia Carson) e Zipp (Liza Koshy) e il fedele compagno Hitch (James Marsden). La loro missione è piena di disavventure, ma questi nuovi migliori amici possiedono ognuno dei doni unici e speciali che potrebbero essere proprio ciò di cui c'è bisogno per ripristinare la magia e dimostrare che anche i piccoli pony possono fare una grande differenza.