È nato a Londra, in Inghilterra. Dopo essersi laureato in Legge presso il prestigioso Kings College di Londra, è approdato al mondo del cinema quando l’apprezzato produttore e regista Frank Marshall lo ha scritturato nel blockbuster della Paramount Congo, inaugurando così una prolifica carriera al cinema e in televisione.
Presto il suo nome è diventato popolare nel ruolo del pericoloso prigioniero Adebisi nella serie televisiva HBO Oz, che gli è valso un grande consenso da parte di pubblico e critica, nonché due nomination al NAACP Award.
Akinnuoye-Agbaje in seguito ha recitato in The Mummy Returns (La mummia – il ritorno), The Bourne Identity e Get Rich or Die Tryin’.
La sua popolarità è cresciuta enormemente grazie al ruolo del misterioso Mr. Eko nell’apprezzata serie televisiva di J.J. Abrams Lost, che è valso a lui e al cast uno Screen Actors Guild Award 2006 come Best Ensemble. Akinnuoye-Agbaje vive a Londra, in Inghilterra.
