Rajat Kapoor e principalmente un filmmaker e un regista teatrale e, come dice lui stesso, "un attore per caso". A 15 anni sapeva gia che avrebbe voluto girare film, e percio ha studiato regia presso il Film and Television Institute of India, a Pune. Il primo film che ha diretto e stato Private Detective: Two Plus Two Plus One (1997). Nel 2003, Rajat ha scritto e diretto il film indipendente Raghu Romeo, vincitore del National Film Award come Miglior Film. In seguito, ha diretto Mixed Doubles, di cui e anche interprete, il tema del film e incentrato su uno stile di vita promiscuo nella Mumbai contemporanea. Altri film che ha diretto sono: Mithya e Fatso.
E' stato candidato come Miglior Attore agli Asian Pacific Screen Awards per Siddharth: The Prisoner, ed ha ricevuto attenzione in ambito internazionale per il ruolo dello 'zio' in Monsoon Wedding di Mira Nair. Inoltre, e apparso in Dil Chahta Hai, Bheja Fry, Corporate, I am 24, Phans Gaye re Obama e Raat Gayi Baat Gayi. Rajat ha vinto tre volte il National Award come regista, inoltre e il presentatore del talk show Indiano Lounge. Il prossimo film che dirigera s'intitola Ankhon Dekhi mentre nel 2013 è il nonno del protagonista Saleem nel film di Deepa Mehta I figli della mezzanotte.