Si è fatti conoscere interpretando William Miller, un personaggio ispirato alla vera storia del giovane Cameron Crowe, nell'acclamata pellicola di questo regista Quasi famosi (Almost Famous).
Nato e cresciuto a Salt Lake City, Fugit ha recitato in diverse produzioni scolastiche da quando era in seconda media. Ha poi ottenuto delle parti in episodi di Promised Land e Il tocco di un angelo (Touched by an Angel). Nel 1998, è apparso nel film televisivo della Fox Marabunta - Attacco alla terra (Legion of Fire: Killer Ants) e, nel 2000, nel film della CBS Beyond the Prairie: The True Story of Laura Ingalls Wilder. Sempre in quell'anno, ha ottenuto la parte in Quasi famosi che ha cambiato la sua carriera.
In seguito ha lavorato a White Oleander, Spun di Jonas Åkerlund, Saved, Dead Birds, The Amateurs, Cool Ideas di Bickford Shmeckler, Wristcutters: A Love Story e, più di recente, in The Good Life.