È stato un’importante forza creativa dei Pixar Animation Studios fin dal 1990, quando è diventato il secondo animatore e il nono impiegato ad entrare a far parte del gruppo ristretto di questi pionieri dell’animazione digitale. Come vicepresidente responsabile per la creatività dirige le varie iniziative e supervisiona lo sviluppo di tutti i film e i cortometraggi dello studio.
Stanton ha recentemente diretto e cosceneggiato WALL•E, che ha ottenuto l’Academy Award e il Golden Globe Award per la miglior pellicola d’animazione del 2008, oltre a conquistare una candidatura all’Oscar per la miglior sceneggiatura originale.
Stanton ha esordito alla regia con la pellicola, che ha battuto diversi record, Alla ricerca di Nemo (Finding Nemo), tratta da una sua storia originale, che ha anche cosceneggiato. La pellicola gli è valsa nel 2003 due candidature all’Oscar (miglior sceneggiatura originale e miglior pellicola d’animazione) e una vittoria nella seconda categoria, che ha rappresentato la prima occasione in cui i Pixar Animation Studios hanno ottenuto questo riconoscimento per un lungometraggio.
Stanton è stato anche uno dei quattro sceneggiatori ad ottenere una candidatura all’Oscar nel 1996 per il suo contributo a Toy Story - Il mondo dei giocattoli (Toy Story) e successivamente si è occupato della sceneggiatura di ogni film della Pixar: A Bug's Life – Megaminimondo (A Bug’s Life), Toy Story 2 Woody e Buzz alla riscossa (Toy Story 2), Monsters & Co. (Monsters, Inc.), e Alla ricerca di Nemo. Inoltre, è stato coregista di A Bug's Life e produttore esecutivo della pellicola, nominata agli Oscar del 2001, Monsters & Co. e di quella del 2007 vincitrice dell’Academy Award Ratatouille.
Nato a Rockport, in Massachusetts, Stanton si è laureato in animazione dei personaggi al California Institute of the Arts (Cal Arts), dove ha portato a termine due film studenteschi. Nel 1980, ha iniziato la sua carriera professionale a Los Angeles, come animatore dello studio Kroyer Films di Bill Kroyer e sceneggiatore nella produzione di Ralph Bakshi Mighty Mouse, The New Adventures del 1987.