A causa dei pericoli per la diminuzione delle risorse e il crescente inquinamento, l'Organizzazione Scientifica Internazionale ha stabilito di migliorare le condizioni ambientali in tutto il mondo. Ma un gruppo internazionale di criminali, Gallactor, cerca di ottenere il dominio del mondo prendendo il controllo della ISO. Gallactor è stato creato da un essere misterioso dello spazio conosciuto col nome di Generalissimo X, che dà gli ordini attraverso il suo comandante in capo sulla Terra, il mascherato Berg Katse. Per combattere Gallactor e i suoi mostri robot, l'ISO del dottor Nambu arruola cinque giovani coraggiosi in una squadra da combattimento chiamata Gatchaman, il Commando Scientifico. Con speciale poteri scientifici e drammatici costumi a forma d'uccello rendono la squadra Gatchaman un degno avversario per Gallactor, che potrebbe colpire ovunque sulla Terra. Ken (l'Aquila) è il saggio leader, assistito dal talvolta temerario Joe (il Condor), la bella Jun (il Cigno), il poco impaziente Jinpei (la Rondine), e il forte Ryu (il Gufo cornuto). Ognuno ha delle armi scientifiche individuali, ma il loro potere principale risiede nel loro aereo, la Fenice, che può trasformarsi in una freccia di fuoco in grado di perforare le più grandi minacce.
