Figlia del regista Francesco Vicario, Margherita Vicario cresce in una famiglia fortemente immersa nel mondo dello spettacolo. Sua nonna è infatti la storica e ottima attrice italiana Rossana Podestà, mentre suo nonno è l'attore e regista Marco Vicario. Professione ereditata anche dallo zio Stefano.
Dopo il successo all'ultima Berlinale, esce al cinema l'11 aprile il suo debutto alla regia, Gloria!, un film dalla carica sovversiva che racconta un coro di giovani orfane che sfida le leggi dell'epoca in una Venezia settecentesca.

Laureata alla Link Campus University in Performing Arts nel 2009, dopo aver studiato anche canto, comincia a lavorare come attrice nel piccolo schermo, apparendo nella seconda stagione del telefilm Mediaset I Cesaroni.
A questo, si aggiungeranno le apparizioni nelle miniserie poliziesche R.I.S. Roma - Delitti imperfetti, 6 passi nel giallo, seguiti da altri ruoli minori in Un passo dal cielo, l'internazionale I Borgia, Amore pensaci tu e la fiction Non ho niente da perdere, diventando poi una dei protagonisti di Nero a metà (2018-2022), con Miguel Gobbo Diaz, Claudio Amendola, Alessandro Sperduti e Sandra Ceccarelli.