Attore americano dal volto da bravo ragazzo della porta accanto, Michael Zegen è, sin da piccolo, dotato di talento comico. Figlio di un avvocato e un'insegnante, è di origini ebraiche: il nonno è sopravvissuto all'Olocausto. Laureatosi nel 2001 allo Skidmore College di Saratoga Springs, New York, Zegen entra a far parte del gruppo di sketch comici di New York "Hottie $ Galore". Un'ottima palestra e trampolino di lancio per il prestigioso palco televisivo del "Late Show with David Letterman", programma in cui appare più di cinquanta volte nei panni di Dwight, il teenager problematico. Nel 2004 compare in un episodio della popolare serie tv I Soprano. Nello stesso anno ottiene il ruolo che imprime una svolta alla sua carriera di attore: quello di Damien Keefe in Rescue Me (2004-2011), serie tv incentrata sulle vite professionali e personali dei vigili del fuoco di New York dopo gli attentati dell'11 settembre 2001. Zegen incarna il nipote del protagonista della serie, il pompiere Tommy Gavin, e nella quinta stagione viene promosso a membro del cast principale, diventando pompiere in prova.

Tra cinema e serie tv
Nel 2005 l'attore ottiene il suo primo ruolo cinematografico, quello di Todd nel drammatico indie Bittersweet Place di Alexandra Brodsky. Dopo un episodio di Love Monkey (2006) e uno di Mercie (2009), interpreta Eddie nel thriller La ragazza della porta accanto (2007) di Gregory Wilson. È Steven Loman nella commedia noir The Assassination - Al centro del complotto (2008) di Brett Simon, con Bruce Willis nei panni del preside di una scuola superiore in cui si consuma la misteriosa scomparsa di alcuni test. Nel 2009 incarna Eric in Adventureland di Greg Mottola, con Jesse Eisenberg e Kristen Stewart nelle vesti di due ragazzi problematici che si innamorano sullo sfondo di un futuro incerto. Zegen appare poi in Motel Woodstock (2009) di Ang Lee, sulla storia dell'organizzazione del più grandioso festival rock mai realizzato. È Garcin nel thriller fantascientifico The Box (2009) di Richard Kelly, con Cameron Diaz. Nel 2011 l'attore incarna Andy Sussman in quattro episodi della serie tv How to Make It in America, che segue due intraprendenti ventenni nei loro tentativi di sfondare nel mondo della moda newyorkese. Dal 2011 al 2012 presta il volto al boss mafioso Bugsy Siegel in sei episodi della celebre serie tv Boardwalk Empire. Nel 2012 è Randall Culver in quattro episodi della serie di grande successo The Walking Dead. Nello stesso anno torna al cinema nel ruolo di Benji nel film da festival Frances Ha di Noah Baumbach, su un'aspirante ballerina che deve fare i conti con la mancata realizzazione del suo sogno e con l'allontanamento della sua migliore amica, che va a vivere con il fidanzato. Zegen incarna un blogger in Ex-Girlfriends (2012) di Alexander Poe, commedia sulle difficoltà dell'amore. Nel 2014 si unisce al cast di Girls, serie che segue le vicende di quattro amiche, poco più che ventenni, che cercano di costruirsi una vita dopo essersi trasferite a New York. Zegen interpreta Joe, il redattore collega di Hannah Horvath, protagonista della serie. Lo rivedremo al cinema nel 2015, nei panni di Maurizio, in Brooklyn di John Crowley, romance su una giovane immigrata irlandese che si innamora di un italiano negli Stati Uniti.