Annabel Scholey ha cominciato la sua carriera con ruoli per la TV in Poirot e nell'adattamento per BBC 1 di Jane Eyre, nel ruolo di Diana Rivers accanto a Toby Stephens e Ruth Wilson. Successivamente ha recitato nei panni di Lauren Drake nella prima stagione della serie nominata ai Bafta Being Human per la BBC ed è stata la protagonista Midge Learner della serie Personal A!airs insieme a Ruth Negga, Laura Aikman e Maimie McCoy. La Scholey ha lavorato molto nel teatro fin dall'inizio della sua carriera. Con la RCS (Royal Shakespeare Company) ha interpretato Cressida nel "Troilo e Cressida" di Peter Stein durante il festival Complete Works. È stata Anya nella produzione di "Il giardino dei ciliegi" di Jonathan Miller, accanto a Joanna Lumley. Ha lavorato a varie produzioni al Minerva Theatre di Chichester, tra cui "Il palazzo degli incontri" diretto da Howard Davies. Ha recitato nei panni di Hermia in "Sogno di una notte di mezza estate" di Peter Hall insieme a Judi Dench, e nella produzione di Hall di "I rivali" nel ruolo di Julia Melville. Più di recente è stata Lady Anna nella produzione Bridge Project di Sam Mendes "Riccardo III" insieme a Kevin Spacey. Lo spettacolo è stato un successo al teatro The Old Vic e alla BAM di New York. Nel 2012 la Scholey è stata scelta per la produzione del National Theatre di "Antigone" all'Olivier, con Jodie Whittaker e Christopher Eccleston. Nel 2012 è apparsa anche nel ruolo di Lucy Pfister in Family Tree, serie TV creata e diretta da Christopher Guest per HBO/NBC/BBC.