Fernando Guillén Cuervo è nato a Barcellona. La sua famiglia è composta di attori molto conosciuti, tra cui i genitori Fernando Guillén e Gemma Cuervo e la sorella Cayetana Guillén Cuervo. Ha esordito al cinema nel 1982 con una parte in Pestañas Postizas assieme ad Antonio Banderas. In seguito, ha lavorato con alcuni dei più importanti registi spagnoli, tra cui Pedro Almodóvar, José Luis Garci, Eloy de la Iglesia, Bigas Luna e Vicente Aranda. Parlando bene l'inglese e il francese oltre ovviamente allo spagnolo, Cuervo ha partecipato ad acclamate pellicole come La legge del desiderio (La ley del deseo), Le età di Lulù (Las edades de Lulú), Boca a Boca, Luz de Domingo e il prodotto comico Airbag - tre uomini e un casino (Airbag), che è diventato un titolo di culto tra i giovani. Ha anche interpretato ruoli minori in film internazionali come 1492 - La scoperta del paradiso (1492) di Ridley Scott e A Business Affair di Charlotte Brandstorm. Inoltre, è un realizzatore e uno sceneggiatore affermato. Infatti, è stato cosceneggiatore del già menzionato Airbag e di Los Novios Búlgaros, del controverso regista di culto Eloy de la Iglesia. Cuervo ha anche diretto due commedie, Año Mariano e Los Mánagers, che si sono rivelate dei grandi successi.