Nata a Memphis, nel Tennessee ha conseguito un master in Cinematografia alla Columbia University e ha realizzato per la tesi, Althea Faught, un cortometraggio sulla guerra civile americana, che viene acquistato dalla PBS nel 1996 e trasmesso su American Play-house. È proiettato inoltre in diversi festival, come il Tribeca First Look Series, l'Edinburgh International Film Festival, il Montreal Festival des Film du Monde e il Los Angeles Independent Film Festival. Il film vince anche il primo premio della Columbia per la Regia.
Il secondo cortometraggio della Hunt, Frozen River, viene proiettato in anteprima al New York Film Festival nel Settembre 2004 e viene proiettato nel contesto di numerosi altri festival, a Los Angeles, Nashville, Williamstown, e all'American Indian Film Festival.
Courtney Hunt si è laureata in legge alla Northeastern University e ha conseguito un Bachelor of Arts al Sarah Lawrence College.
