Boaz Yakin è nato a New York. I suoi genitori erano due artisti, che si sono incontrati a Parigi mentre entrambi studiavano mimo con Marcel Marceu.
Dopo il diploma, Yakin decide di studiare regia al New York College. Quando si trasferisce alla New York University a soli diciannove anni, chiude il suo primo contratto da sceneggiatore. Il suo primo lavoro ad esser realizzato è stato The Punisher. L'anno successivo fu la volta de La recluta (The Rookie) con Clint Eastwood e Charlie Sheen.
Alla ricerca di qualcosa di più personale, Yakin ha diretto Fresh con Samuel L. Jackson e Giancarlo Esposito, film scritto di suo pugno, che ha ricevuto ottime critiche, ottenendo il Filmmaker's Trophy nel 1994 al Sundance Film Festival, un premio al Festival di Tokyio e altri riconoscimenti europei.
Yakin ha anche lavorato ai film: Il profumo della vittoria, con Denzel Washington, prodotto da Jerry Bruckheimer, che ha ottenuto grande successo di pubblico e critica; La ragazza dei quartieri alti (Uptown Girls) con Brittany Murphy e Dakota Fanning. Con Eli Roth e Scott Spiegel ha fondato la società Raw Nerve, con cui hanno prodotto Hostel. Di recente ha prodotto e diretto il film Death in Love presentato al Sundance Festival nel 2009.